Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NRF1Q16656 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NRF1Q16656 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NRF1Q16656 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NRF1Q16656 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NRF1Q16656 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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NRF1Q16656 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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