Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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