Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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