Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms