Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VarsQ9Z1Q9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms