Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChrdQ9Z0E2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms