Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms