Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms