Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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