Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms