Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d4aQ9D7V1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d4aQ9D7V1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms