Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc130Q9D516 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc130Q9D516 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms