Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcc1Q9D4H2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms