Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms