Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms