Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd3Q9CRB9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms