Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQC3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQC3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms