Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NepnQ9CQ76 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NepnQ9CQ76 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NepnQ9CQ76 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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NepnQ9CQ76 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NepnQ9CQ76 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NepnQ9CQ76 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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