Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncbp2Q9CQ49 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms