Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1810009J06RikQ9CPN7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1810009J06RikQ9CPN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms