Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms