Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms