Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec16bQ91XT4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec16bQ91XT4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms