Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6K7

SAMD3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD3Q8N6K7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD3Q8N6K7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD3Q8N6K7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms