Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcl3Q8BVF2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcl3Q8BVF2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms