Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms