Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc181Q80ZU5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc181Q80ZU5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc181Q80ZU5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc181Q80ZU5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc181Q80ZU5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc181Q80ZU5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc181Q80ZU5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms