Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl2Q78Y63 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl2Q78Y63 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms