Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR3Q6ZT12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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