Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpbp1Q6NXH3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpbp1Q6NXH3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms