Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms