Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms