Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema3bQ62177 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms