Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1aQ61495 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms