Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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Pfdn4Q3UWL8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms