Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uri1Q3TLD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms