Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPS1Q13098 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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GPS1Q13098 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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GPS1Q13098 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPS1Q13098 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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