Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PRDM2Q13029 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
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