Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
StumQ0VBF8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
StumQ0VBF8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms