Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms