Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms