Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdsp1P58466 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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