Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms