Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms