Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms