Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FmodP50608 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FmodP50608 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FmodP50608 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FmodP50608 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms