Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1A1P48729 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1A1P48729 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms