Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox6P40645 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox6P40645 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms