Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms