Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BdnfP21237 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms